From 3124e86a761e393c9618f7984ce3e019900bf565 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: David Fischer <davidfischer99@gmx.de> Date: Tue, 13 Jun 2023 20:16:19 +0200 Subject: [PATCH] put references in seperate dir --- project2/resources/references/alpha.fasta | 428 ++++++++++++++++++ project2/resources/references/delta.fasta | 428 ++++++++++++++++++ project2/resources/references/omicron.fasta | 428 ++++++++++++++++++ project2/resources/{ => references}/ref.fasta | 2 +- 4 files changed, 1285 insertions(+), 1 deletion(-) create mode 100644 project2/resources/references/alpha.fasta create mode 100644 project2/resources/references/delta.fasta create mode 100644 project2/resources/references/omicron.fasta rename project2/resources/{ => references}/ref.fasta (99%) diff --git a/project2/resources/references/alpha.fasta b/project2/resources/references/alpha.fasta new file mode 100644 index 0000000..c375201 --- /dev/null +++ b/project2/resources/references/alpha.fasta @@ -0,0 +1,428 @@ +>OL689430.1 Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 isolate SARS-CoV-2/human/CHE/B.1.1.7/2020, complete genome +ACCTTCCCAGGTAACAAACCAACCAACTTTCGATCTCTTGTAGATCTGTTCTCTAAACGAACTTTAAAAT +CTGTGTGGCTGTCACTCGGCTGCATGCTTAGTGCACTCACGCAGTATAATTAATAACTAATTACTGTCGT +TGACAGGACACGAGTAACTCGTCTATCTTCTGCAGGCTGCTTACGGTTTCGTCCGTGTTGCAGCCGATCA +TCAGCACATCTAGGTTTTGTCCGGGTGTGACCGAAAGGTAAGATGGAGAGCCTTGTCCCTGGTTTCAACG +AGAAAACACACGTCCAACTCAGTTTGCCTGTTTTACAGGTTCGCGACGTGCTCGTACGTGGCTTTGGAGA +CTCCGTGGAGGAGGTCTTATCAGAGGCACGTCAACATCTTAAAGATGGCACTTGTGGCTTAGTAGAAGTT +GAAAAAGGCGTTTTGCCTCAACTTGAACAGCCCTATGTGTTCATCAAACGTTCGGATGCTCGAACTGCAC +CTCATGGTCATGTTATGGTTGAGCTGGTAGCAGAACTCGAAGGCATTCAGTACGGTCGTAGTGGTGAGAC +ACTTGGTGTCCTTGTCCCTCATGTGGGCGAAATACCAGTGGCTTACCGCAAGGTTCTTCTTCGTAAGAAC +GGTAATAAAGGAGCTGGTGGCCATAGTTACGGCGCCGATCTAAAGTCATTTGACTTAGGCGACGAGCTTG +GCACTGATCCTTATGAAGATTTTCAAGAAAACTGGAACACTAAACATAGCAGTGGTGTTACCCGTGAACT +CATGCGTGAGCTTAACGGAGGGGCATACACTCGCTATGTCGATAACAACTTCTGTGGCCCTGATGGCTAC 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b/project2/resources/references/ref.fasta similarity index 99% rename from project2/resources/ref.fasta rename to project2/resources/references/ref.fasta index 7ca3347..b15a9f0 100644 --- a/project2/resources/ref.fasta +++ b/project2/resources/references/ref.fasta @@ -426,4 +426,4 @@ GTGCAGAATGAATTCTCGTAACTACATAGCACAAGTAGATGTAGTTAACTTTAATCTCACATAGCAATCT TTAATCAGTGTGTAACATTAGGGAGGACTTGAAAGAGCCACCACATTTTCACCGAGGCCACGCGGAGTAC GATCGAGTGTACAGTGAACAATGCTAGGGAGAGCTGCCTATATGGAAGAGCCCTAATGTGTAAAATTAAT TTTAGTAGTGCTATCCCCATGTGATTTTAATAGCTTCTTAGGAGAATGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA -AAAAAAAAAAAAA \ No newline at end of file +AAAAAAAAAAAAA -- GitLab