Für alle Schritte schauen welche Parameter der Tools man dem Nutzer über das configfile zugänglich machen kann. Als absolutes Minimum sollte der Nutzer für jedes Tool zumindest den gesamten Parameter-String übergeben können. Das was in der Snakemake (insb. Wrapper) Welt oft als "extra" verwendet wird.
seehagec01 (0d3f9a4c) at 19 May 16:44
fix #4 + final workflow
seehagec01 (d377dd55) at 11 May 12:48
added fastp params #4
seehagec01 (225e298c) at 11 May 10:14
added quast + multiqc rules
seehagec01 (c0588869) at 10 May 10:44
wd update
seehagec01 (f0f82661) at 10 May 10:41
updated snakefile
seehagec01 (51249571) at 10 May 10:40
shiver + seqkit
2>>{log}
statt 2>{log}
verwendenseehagec01 (4956b079) at 10 May 10:30
fix #5
resources/reference/reference.fa
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