bowtie2
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Den Nutzer den Pfad zur Host Fasta-Datei angeben lassen und nicht über fixen Pfad resources/reference/reference.fa
regeln -
Entweder für beide rules den wrapper verwenden oder für keine. So ist die Gefahr, dass man beim updaten (entweder Wrapper version oder Conda Version) nicht genau aufpasst und unterschiedliche bowtie Versionen für die beiden Schritte verwendet.